孙元，又名铭，号竹丹，安徽省寿县人，同盟会成立之始，即入会为会员，曾任同盟会安徽分会会长，后因为著名革命党人熊成基被清廷杀害而遭同盟会内部少数人怀疑，惨死于自己人之手，成为同盟会内部最大的冤案。

孙元19岁从江南陆军学堂毕业后，即赴日本留学，继续学习军事。1905年，他又参与发起建立同盟会，并被推举为安徽分会会长。次年回国，曾经与孙毓筠等人发动武装起义，失败后再度赴日。1907年他又回国，到东北三省从事秘密反清活动。这时，因为领导安庆起义而受到清廷通缉追捕的熊成基，也流亡到吉林长春，于是孙、熊二人遂通力合作，为革命筹措经费。不久，孙元去北京筹款，而这时熊成基被叛徒臧冠三出卖，不幸被捕，而孙元也因为受熊成基案株连受到清政府通缉。孙元无路可走，第三次去了日本。

但是不知道什么缘故这时从香港传来消息，说孙元是出卖熊成基的叛徒，已经被清廷收买为密探，希望各地革命党提高警惕。而这类明显不实的小道消息，竟然为留居日本的部分同盟会会员所深信，居然在没有报告同盟会总部的情况下，暗中组织一些人要为革命“除奸”。孙元因为根本没有想到会遭自己同志暗算，所以丝毫不加防备。一日，这些自称“为革命除奸”的会员，把孙元约到东京市郊，趁其不备，用哑铃猛击他的头部，致使他双目外凸而死，接着又残忍地把他的遗体割为数段，盛于箱内，运到海上抛尸。这时孙元年仅29岁。

1912年，中华民国成立，孙元冤案被人披露，于是宋教仁、刘揆一、柏文蔚、孙武、柳亚子等几十位同盟会元老会员纷纷出来公开作证，至此，孙元这个同盟会内部最大的冤案才大白于天下。